Доброго времени суток.
1) В "Руководстве по эксплуатации" для Весна-ТЭЦ2-3К немного неверно отражены разъемы для подключения (они будут верно отражать назначение разъемов, если на контроллер смотреть сзади). На самом контроллере на задней стороне есть их обозначение, руководствуйтесь ими.
2) Для подключения контроллера к ноутбуку подойдет любой переходник, создающий виртуальный COM-порт и который имеет на входе USB, а на выходе - RS232. Ставите драйвер, появляется в устройствах новый COM-порт, и вся работа с контроллером будет идти через него. ДУмаю, проблем у Вас возникнуть не должно.
3) Пины не перепаяны. Стандартный COM кабель для связи ПК с "Весна-ТЭЦ2-3К" идет в комплекте с контроллером.